RNA Sequencing

國內領先的轉錄組定序基地

Transcriptome Sequencing 可全面性並快速地獲得某一物種特定細胞或組織在某一狀態下的幾乎所有的轉錄體 (transcriptome)及基因序列,可以用於研究物種基因結構和基因功能、選擇性剪接和新的轉錄序列 (transcript)預測等。針對轉錄體定序研究,與全基因體定序研究一樣,可分為兩種類型:一種未知參考序列 (No Referenece Genome) 的物種轉錄體定序;另一種則是已具有參考序列的物種轉錄體定序(例如:人類、水稻)。而相對於傳統微陣列晶片 (microarray),轉錄體定序無須預先針對已之序列設計探針 (probe),即可對任意物種的轉錄體進行監測,不但可以提供高精確度的量化信號,且具有高通量與高靈敏度等特性,是深入研究轉錄體的強大工具。

目前,RNA Sequencing已經被廣泛應用於動植物優良基因篩選以及疾病研究等方面。有勁生技利用標準化的實驗流程、先進的定序平台與專業的生物資訊分析打造出國內領先的轉錄體定序實驗室,以高效率、高質量的科技服務贏得專業人士的良好口碑。 

在生物體中,不同的部位、不同發育階段、或是處於不同環境下所表現的mRNA (messenger RNA)表現均不相同。藉由已知參考序列 (基因體參考序列或是轉錄體參考序列) 的物種之mRNA高通量定序,搭配適當的生物資訊分析流程,便可計算出在不同樣品中的各基因表現量。根據客戶不同的實驗設計,更可以進行樣品和樣品間的基因差異表現量 (differential expression)分析、不同條件下的選擇性剪接 (alternative splicing)轉錄分析、以及功能性的分析,包含: Gene Ontology(GO)與生物調控路徑 (pathway analysis)。

適用研究目的

  • 偵測基因表現量。
  • mRNA選擇性剪切型態。
  • 究物種基因結構和基因功能、選擇性剪接和新的轉錄序列 (transcript)預測等

範例報告

RNA Sequencing。如有任何疑問,歡迎致電/來信指教。

建議策略

 產品
 mRNA Sequencing 
 常見研究目的
研究物種基因結構和基因功能、選擇性剪接和新的轉錄序列 (transcript)預測
 建議定序規格
* 定序平台:Proton/Illumina 
* 定序方式:Single-End/Paired-End 
* 定序長度:100-300pb
 建議定序資料量/定序深度
 5G
 特殊限制
 需有參考序列 (Reference sequence)
* 如需其他建議策略,歡迎致電/來信詢問。

樣品需求規格

生資分析流程

樣品類別
定序項目
分析層級
生物資訊分析策略
RNA
RNA sequencing
Basic

 ● Quality trim

 ● Mapping to reference genome

 ● Gene expression

Advanced

 ● Quality trimmed

 ● Mapping to reference genome

 ● Gene expression

 ● Differential expression analysis

 ● GO analysis for genes with significantly different expression level

 ● KEGG metabolic pathways for genes with significantly different expression level

* 如需客製化生物資訊分析流程,歡迎致電/來信指教。


TOP